از دل کوه نمکدان و از میان غار یک جریان آب زیرزمینى دائمى مىجوشد و راه خود را به خارج مىگشاید که پس از حل کردن نمک در مسیر حرکت خود، بهصورت چشمه در دامنه کوه ظاهر مىشود و در گودال مقابل خود حوضچهاى طبیعى بهوجود مىآورد. منظره این حوضچه از دور همچون سطح وسیعى انباشته از برف زمستانى دیدنى است. این چشمه در تمام فصلهاى سال جریان دارد. نمک موجود در غار کوه نمکدان از بهترین نوع نمک سر سفره شناخته شده و در ترکیب آن عناصر دیگرى (همچون منیزیم) وجود دارد. بههمین دلیل مىتواند بهعنوان نمک طبى بهویژه براى مصرف ورزشکاران حرفهاى ـ استخراج و بهصورت کپسول مصرف شود. نظیر غار نمک جزیره قشم در کمتر نقطهاى از ایران و جهان دیده شده است. تحقیقاتى که اخیراً بر روى فضاى داخلى غار نمکدان انجام شده نشان مىدهد که این غار داراى قابلیت ویژهاى است که باقىماندن و تنفس در آنها مىتواند به بهبود بیماران مبتلا به آسم و ناراحتىهاى تنفسى کمک کند.